L'episodio inizia con Lois, Clark e Chrissy che cercano di capire cosa sta facendo Morgan Edge e come l'X-Kryptonite è legato ai candidati che Lana ha raccolto per il suo programma di leadership. Passa a Edge che chiede a Emily se vuole diventare la 'migliore di sé' ed Emily accetta l'offerta. Successivamente, vediamo che Lana è tornata a cercare candidati. Lois vuole impedire alle persone di lavorare con Edge e spera che la storia di Clark in città possa essere d'aiuto, dal momento che Martha aiuta le persone in città da anni. Alla Gazzetta, Lana va a trovare Lois e Chrissy.
La interrogano su cosa sta succedendo con il programma di leadership e lei può dire loro solo cose molto generali. Lois dice a Lana che dovrebbe prendersi una pausa, ma Lana non ne ha.
Al liceo, Kyle dice a Jon e Jordan che apprezza davvero che siano lì per Sarah. Sta parlando con Jordan mentre Jonathan viene distratto da Teegan Wickham, la stessa ragazza carina dell'ultimo episodio.
Programma di rilascio dell'episodio della seconda stagione di un pugno di uomini
Clark incontra Emily in una tavola calda, dove lei gli dice che il programma di Edge la sta aiutando a mantenere una disposizione migliore e una mente più chiara, e incoraggia Clark a unirsi a lei. Improvvisamente, Clark sente una rapina in banca in corso in Messico e vola lì per fermarla, ma a metà strada i suoi poteri iniziano a svanire. È svenuto per un momento prima di rialzarsi per finire il lavoro, ma vola a casa chiaramente disturbato.
Al giornale, Chrissy dice a Lois di un nuovo annuncio che Edge sta pubblicando, cercando il doppio dei candidati per il programma. Lois partecipa alla riunione dello staff e dice alle persone presenti che Edge sta pianificando di mettere poteri e coscienze kryptoniani nella gente di Smallville. Lui le dice che nessuno le crederà, e lei gli dice che non pubblicheranno il suo annuncio, ma questo non lo preoccupa molto. La incoraggia a usare il suo dispositivo di segnalazione per chiamare Superman, dicendo che è rischioso, sapendo che è kryptoniano e che è entusiasta di scoprire con chi si schiererebbe.
A casa, Clark sta coprendo alcuni lividi causati da colpi di pistola quando Lois entra per fargli sapere cosa sta succedendo, e lei va fuori di testa. Capiscono che è probabile dal gas con cui Rosetti lo ha colpito, e Lois decide di chiamare Sam.
A scuola, Jordan e Sarah stanno flirtando al pianoforte quando inizia a starnutire e la sua mano è coperta di ghiaccioli, poiché il suo respiro congelato ha iniziato a prendere piede. Si precipita fuori dalla porta, lasciandola ferita e confusa. Prima che possa uscire dalla scuola, Clark viene a prenderlo, dicendogli che devono parlare con il Dipartimento della Difesa degli effetti della tossina sintetica Kryptonite.
Alla fattoria, Clark spiega a Jordan che l'arma alla kryptonite ha apparentemente causato a Clark una malattia trasmissibile. Sam dice a Lois che sta lavorando per ottenere una cura.
A scuola, Jonathan si ferma per vedere Sarah, che chiede dove sia Jordan e racconta a Jon cosa è successo. Jon gli promette di trovarlo e Sarah è preoccupata perché è la prima esibizione musicale del concerto.
Al lavoro, Lana incontra Emily e la chiacchiera un po'. Leslie va a prendere Lana e la porta nell'ufficio di Edge per farle la stessa offerta che ha fatto a Emily.
Alla Fortezza, l'ologramma di Jor-El dice a Clark che possono estrarre la Kryptonite dai polmoni di Jordan, ma dovranno bruciarla con un calore intenso. Clark consola Jordan e lo trattiene durante la procedura.
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Tornato a casa, Jon si unisce alla famiglia e Jordan si sta ammalando sempre di più. Non potendo più aspettare Sam, Clark fa volare Jordan alla Fortezza. Lois dice a Sam che non può più fidarsi di lui con suo marito o i suoi figli, quindi ha bisogno di uscire dalla sua vita quando tutto questo sarà finito.
Tornato alla fattoria, Jonathan cerca di aiutare Lois a sentirsi meglio per tutto il pericolo che i bambini hanno corso da quando i poteri di Jordan hanno iniziato a manifestarsi. Le assicura che Clark sarà in grado di aiutare Jordan. A scuola, Sarah non riesce a trovare Jordan all'ora dello spettacolo. Lana è seduta con Kyle ed Emily, e Kyle si intrufola nel backstage per aiutarla a sostenerla quando è pronta ad arrendersi.
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Tornato alla fattoria del Kent, Jonathan rimprovera suo nonno, definendolo un codardo per non aver creduto in Clark.
A metà dell'esibizione di sua figlia, Emily sente improvvisamente qualcosa e si alza per andarsene, confondendo Lana e Sarah. Kyle si offre di seguirla per vedere cosa c'è che non va. Tornato a Edge, Morgan dice a Leslie che con Superman indebolito, ha attivato alcuni dei loro Subjekt per sconfiggere Lois.
Alla Fortezza, Clark termina la terapia fisica kryptoniana di Jordan. Tornata alla fattoria, Lois riceve una telefonata da Lana, che la avverte che Emily si comporta in modo strano. Bussano alla porta, ed è Emily, in piedi con un altro Subjekt, entrambi con gli occhi rossi arrabbiati alimentati dalla visione di calore. Caricano Lois e rubano il suo dispositivo di segnalazione, ma Sam Lane irrompe con una granata a gas Kryptonite e li tiene occupati mentre Lois e Jonathan possono raggiungere il fienile, dove Jon ha portato via alcune delle armi di John Henry. Kyle arriva al fienile, dove chiede cosa sta succedendo e Lois gli dice che Edge ha mandato delle persone per ucciderli. Kyle si accende e gli altri due mettono al tappeto Sam e si precipitano nel fienile. Alla Fortezza, Clark sente qualcosa e vola in aria con Jordan, pochi istanti dopo un momento cuore a cuore sul fatto che Jordan non ha chiesto nulla di ciò che gli sta accadendo.
Attraverso una combinazione delle armi di John Henry, di Sam e di un'apparizione tempestiva di Superman, il trio viene respinto.
Sam dice a Lois che ora darà la priorità a Smallville e alla famiglia, e lei gli dice bene, perché è preoccupata che la guerra di cui parlava John Henry stia arrivando.
Nella loro camera da letto, i ragazzi parlano di quello che sta succedendo e Jordan si preoccupa che Sam dirà tutto a Sarah. La chiama per cercare di anticipare la cosa, ma lei non risponde alla chiamata, e Kyle torna a casa per dire a Lana che non riesce a ricordare nulla di quello che è successo dopo aver lasciato il recital. Lana lo convince ad ammettere che ha accettato l'offerta di Morgan Edge, e mentre lei sa che è male, Lana non è ancora al 100% consapevole di quanto sia grave.
Chrissy chiama Lois, rivelando che la sua ricerca indica che Leslie e l'attaccante dell'hotel del pilot erano entrambi originari di Smallville, il che significa che è l'esposizione a lungo termine all'X-Kryptonite che rende i residenti di Smallville ricettivi agli effetti dell'X-Kryptonite. È allora che Clark sente il dispositivo di segnale e vola via per vedere chi lo sta chiamando. È Edge. Nei momenti finali dell'episodio, Edge, ora vestito con un super-abito nero, rivela di avere dei poteri. A differenza dei suoi topi da laboratorio, però, non ha poteri donatigli da X-Kryptonite. Piuttosto, li ha avuti tanto quanto Clark. Chiama Clark suo fratello, e poi l'episodio diventa nero.